Analisis Keragaman Genetik Tumbuhan Nanas (Ananas comosus (L.) Merr.) dengan Marker RAPD (Random Amplified Polymorphic DNA)

Abstrak

Tumbuhan Nanas (Ananas comosus (L.) Merr.) adalah tumbuhan semak dari famili Bromeliaceae. Tumbuhan ini diketahui memiliki banyak kesamaan baik secara morfologi maupun anatomi. Tetapi, secara genetik memiliki banyak perbedaan. Perbedaan genetik yang banyak menjadikan tumbuhan nanas sebagai sumber keragaman genetik. Sumber keragaman
genetik dapat diperoleh dari populasi pada suatu wilayah. Keragaman genetik dapat diidentifikasi berdasarkan marker atau penanda. Salah satu marker keragaman genetik yang dapat digunakan adalah RAPD. Marker RAPD mengamplifikasi DNA polimorfisme secara acak dan dapat diamati berdasarkan pita polimorfik. Sehingga, tujuan penelitian ini dilakukan untuk menganalisis dan mengindentifikasi keragaman genetik tumbuhan nanas (Ananas comosus (L.) Merr.) dengan marker RAPD. Metode yang digunakan adalah PCR DNA dengan tiga primer, yaitu OPA 4, 9, dan 13. Ketiga primer setelah amplifikasi PCR DNA dilakukan skoring matriks 0 dan 1. Nilai matriks 0 (tidak ada pita) dan 1 (ada pita). Nilai matriks dianalisis dengan program NTSYS-pc menggunakan prosedur Similarity for Quantitative Data (SIMQUAL). Hasil penelitian menunjukkan terbentuk banyak pita polimorfik dengan primer OPA-4 dan 13 daripada OPA-9. Karena OPA-9 terbentuk pita monomorfik yang mengindikasikan bahwa tidak ada keragaman genetik. Karena keragaman genetik dapat diperoleh pada pita polimorfik.